
一、基因信息分析及SgRNA设计(4个工作日)
1.根据给定GeneID或Gene name,分析基因结构及功能,寻找保守结构域,在保守结构域或客户指定区域设计靶点,进行生物信息学分析。
2. 通过生物信息学分析目标基因(如生长激素基因、免疫相关基因)的保守区域,设计5-10条 sgRNA 靶点。
3.利用软件预测(如 CHOPCHOP)评估靶点效率与脱靶风险。
二、SgRNA合成及体外筛选(15个工作日)
1.基因组 DNA模板制备,设计鉴定基因编辑结果的PCR引物对。
2.合成并制备5-10条sgRNA,并利用体外切割实验评估sgRNA的切割效率,筛选出高编辑活性的sgRNA。
三、受精卵SgRNA活性验证(30个工作日)
1.优选的5条sgRNA分别和Cas12a共注射受精卵,使基因产生移码突变。
注:若服务品种为非斑马鱼,需客户自行准备鱼卵,在现场产卵1小时内注射完成。且注射后需要客户自行孵化养殖。
2. 待胚胎发育后,取部分提取基因组DNA模板,通过PCR扩增并送测序,筛选出活性高的sgRNA。
四、稳定遗传F0代品系培育(60个工作日-根据鱼成熟周期决定)
1. 将上述经过验证有活性的sgRNA和Cas12蛋白混合后,按上述相同的方法显微注入受精卵。然后将按常规饲养,当生长至两月龄时,剪取尾鳍,扩增目标基因组DNA片段。将获得的PCR产物直接送测序,确认体细胞被基因编辑。然后将鱼卵饲养至性成熟,共获得约50尾后代。得到稳定遗传F0代品系。
五、培育F1代突变体(150个工作日-根据鱼成熟周期决定)
1.收取F0自交的胚胎,获得不少于100尾以上的F1。将F1按常规饲养至2个月时,选取10尾鱼,剪尾鳍,进行基因型鉴定。再以引物对F-gene和R-gene进行PCR扩增。将PCR产物直接送测序,通过直接读测序的色谱图,确认每一尾鱼是否成功被基因编辑。
六、基因编辑品系的建立
遗传稳定性测试:选育2-3代,验证编辑位点性状的稳定性
性状稳定性测试:选育2-3代,在室内和野外验证所改良性状的稳定性,如:快速生长、抗病、抗逆等性状。
水生动物基因编辑技术服务项目









