云南依托立体气候与生态优势，构建了以“1+10+N”为核心的高原特色农业体系，茶叶、中药材、咖啡等产量全国领先。微生物组作为农业生产全周期的核心生物要素，驱动土壤肥力、作物健康、秸秆还田、绿色肥料及农产品发酵等过程，是农业绿色转型的核心引擎。然而，云南虽为“微生物王国”，却因缺乏农业微生物组研究平台，面临三重系统性瓶颈，即种植环节中“环境-土壤-作物-微生物”互作网络不清；加工环节中“微生物-底物-环境”代谢网络模糊，风味与安全调控依赖经验；合成菌群产品开发存在靶向性、适配性、递送性技术短板，难以实现产业赋能。这些关键瓶颈问题已成为制约高原特色农业绿色转型的短板。
为破解上述瓶颈问题，推动云南高原特色农业高质量发展，云南省科技厅支持启动云南省农业微生物组重点实验室（筹）建设。实验室立足云南“微生物王国”的资源禀赋，紧扣高原特色农业产业绿色升级的现实需求，着力破解微生物组资源向新质生产力转化的科学壁垒，将聚焦烟草、茶叶、药材、咖啡等特色作物种植提质与加工增效，构建“基础研究-技术突破-产业应用”全链条创新体系，设置三大攻关方向：一是作物微生物组方向，探究特色作物生态种植中的微生物组演变规律与调控机制，着力构建农业微生物组战略资源库；二是农产品制造微生物组方向，瞄准普洱茶、烟叶、咖啡、乳制品等高原特色农产品加工环节，解析并精准调控微生物组，创制益生菌群发酵剂及智能装备，助推产业现代化升级；三是微生物组产品创制方向，推进合成菌群的研发与应用，开发耐紫外包埋材料、拮抗菌群修复技术及茶、咖、乳专用发酵剂，直接服务于高原特色农业的生态种植与智能制造。旨在打通“菌种—工艺—产品—标准”的完整创新链条，为云南高原特色农业的绿色转型提供坚实的科技支撑。
在实验室启动会暨第一届学术委员会上，云南省中药材现代农业产业技术体系首席科学家、红河学院校长杨生超教授受聘担任实验室学术委员会主任。中国科学院微生物所刘宏伟研究员、中国科学院昆明植物研究所杨祝良研究员作题为《药食同源真菌靶向调控肠道菌群改善代谢性疾病的机制研究》《担子菌的适应性进化》的主旨报告。实验室主任、云南农业大学赵明教授作实验室建设情况汇报。实验室学术委员会委员、云南农业大学相关代表见仁见智，对实验室建设提出意见建议。
