微生物与人类的关系紧密，微生物实验室的应用前景广阔，如今已经应用在农业、食品、医疗、工业和研究等领域，未来可能有更多的应用领域。
微生物实验室的建设是个系统工程，对实验室建筑设计、安全防护设施、实验操作规程和人员专业水平均有非常严格的要求。不同于一般实验室，微生物实验室是指进行微生物研究的场所。其主要研究的对象是微生物、微生物工程发酵，所研究的是微生物的行为习惯、外部结构和表观现象等。微生物实验室必须保证人身、环境、样本等安全，才能使其长期运行下去。
微生物学实验室的布局应本着符合保护工作人员的健康，防止交叉感染，有利于样品送检和保证工作质量的要求，以下是关于微生物实验室在设计中需要考虑的几个方面：
一、实验室选址：
实验室应远离城市生活区与交通要道；同时采光条件、通风较好的地方，同时也要满足方便扦样与检验，距离车间较近的工作场所。
根据工作领域，微生物实验室不同房间设计方案一般不同，但在基础设计上有着通用要求。例如这些房间的共同特点是地板和墙壁的质地光滑坚硬，仪器和设备的陈设简洁不繁杂，便于打扫、清洁卫生。
二、实验室布局：
1、办公室：办公室是化验人员进行原始记录等各项工作的场所，是与非化验室人员交往较多的场所，因此，应设在整体综合化验室的最外层，只需有桌、椅等简单设施即可。
2、准备室：设实验台、试剂柜等要绝缘、耐热、实验台要耐水耐腐蚀：设置上下水装置，涉及粉末，筛分等操作，需配置相应的设备。局部排风，设排风柜。
3、细菌检验操作室（常规操作）细菌检验操作室是细菌培养与检验主要操作室，主要设施是实验台。
4、无菌室：无菌室通过空气的净化和空间的消毒为微生物实验提供一个相对无菌的工作环境，无菌室是处理样品和接种培养的主要工作间，应与细菌检验操作室紧密相连。
5、培养基制作室：培养基室是制作、配制微生物培养所需培养基及检验用试剂的场所，其主要设备应为边台与药品柜。
6、洗涤室：洗涤室房间的尺寸根据日常工作量决定，一般不小于一个单间，洗涤室的位置靠近培养室，给排水设施完善，洗涤台面须耐热耐酸，室内配器皿柜，滴水架，干燥架，边台等，地面应有良好的排水坡度和地漏，其面积应大于10m2 。
其他方面注意事项：
1、各个科室之间应设单独区域，并且安装隔离门，在比较重要的实验室中要设立好缓冲区，进入实验室人员可在缓冲区二次清洁及更换衣物。
2、实验室（含缓冲间）围护结构内表面要光滑耐腐蚀、防水，以易于消 毒清洁。所有缝隙要加以可靠密封。实验室内所有的门均可自动关闭。
3、除观察窗外，不得设置任何窗户。观察窗要求密封结构，所用玻璃为不碎玻璃。地面应无渗漏，光洁但不滑。不得使用地砖和水磨石等有缝隙地面。
4、通风空调系统为直排系统，不得采用部分回风系统。
5、实验室家具要牢固可靠。为易于清洁，各种家具和设备之间应保持一定间隙。应有专门放置生物废弃物容器的台架。家具和设备的边角和突出部位应光滑、无 毛刺，以圆弧形为宜。
微生物实验室是实验室建设中需要注意的方面十分的多，任何一点的疏漏都会使微生物实验室得不到真正的使用，所以专业的团队才能对实验室负起相应的责任。
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