现在，我国对科技事业的重视程度与日俱增，科研经费的投入亦是连年增加，但也暴露出一些问题，如科研经费效率低下、投入方式不合理等。
中国科学院海洋研究所研究员周名江就上述问题指出，从科研事业的现状来看，有相当部分科研工作效率不理想，除体制、原有基础以及其他原因外，现行科研经费投入方式的不合理是重要原因之一。
上世纪80年代，国家推行“课题核算制”，这项制度在当时科研经费紧张的情况下的确起到了一定的促进作用，但也带来了严重的负面效果：在那种体制下，科研人员无法专注于研究工作，研究人员需要将大量的时间花在“找”项目上，这无疑严重影响到原来已承担和将要承担的项目的科研质量。由此也导致了“十个人干一个项目”和“一个人干十个项目”这样极不合理的状况。
这种现象在一些研究机构中较为普遍，且已变成影响我国科研投入的产出质量即科研经费效率的重要因素。这种状况，也助长了科技界的浮躁风。
周名江表示，随着国家科研投入的逐步增加，原先不尽合理的制度亟待改革。
他建议，首先改变我国科研经费投入的方式，从最基本层面重新分配科研投入的比例，减少“需要竞争项目”经费，增加研究院所的事业经费和“基本研究经费”，从根本上保证科研人员最基本的研究条件和研究经费，使得研究人员能定下心来搞研究、静下心来做学问;不同课题组间组成强有力的研究团队，协同瞄准同一科学问题展开研究。
据周名江介绍，目前国内海洋研究机构人均总经费已达到发达国家相似研究所的水平。但值得注意的是，我国研究机构的经费有相当部分是“竞争”来的，存在不合理的、低效率的项目情况。周名江建议：“如果国家科研经费投入方式有一定的改进，强度不变，将会极大地提高研究效率。”
此外，继续加强“限项”的有效性，也是提高经费使用效率的有效手段。据周名江介绍，“限项”要包括所有国家投入的项目，如科技部、财政部、基金委，以及其他各部委的自有研究项目和国家委托的专项、行业性项目等，只要是国库经费支持的项目应该全部进入“限项”数据库。这既保证了国家科研投入的效率，也保护了科研人员的身心健康，使得我国的科研会有一个更快、更好的发展，产出更多高水平的成果。